Juicebox VR

استكشاف البيانات الجينوم التسلسل مرحبا-C 3D في بيئة الواقع الافتراضي!

Juicebox VR يخلق تمثيل الواقع الافتراضي من البيانات التي تم إنشاؤها بواسطة طريقة مرحبا-C لمدة ثلاثة الأبعاد الجينوم التسلسل. كل موقف 2D في المشهد يتوافق مع زوج من المناصب 1D، أو مواضع، في الجينوم البشري ثلاثة مليارات أحرف طويلة. ارتفاع في موقف 2D يمثل عدد المرات مواضع هما على اتصال في نواة الخلية.

منذ مواضع قريب في كثير من الأحيان عثرة إلى واحد آخر، وهو "الجدار" الهائل من الاتصالات قصيرة المدى يشطر المناظر الطبيعية. الهضاب مربع نزوله تتوافق قطري إلى مجالات الجينومية المختصرة، ودعا المجالات للإتصال به. قمم في المشهد تتوافق مع الحلقات في الجينوم. وغالبا ما ترسيمها مجالات الاتصال عن طريق الحلقات، والذي هو السبب في المجالات مربع يكون في كثير من الأحيان قمم في زاويتهم.

وسوف تحكم تطير في أيهما الاتجاه الذي تنظر. تنظر مباشرة للحصول على قفزة عظمى.

تم إنشاء Juicebox VR محمد شميم، ايدو Machol، واريز ليبرمان ايدن.

ويوجه البيانات من:

سوهاس راو *، مريم * هنتلي، نيفا C. دوراند، ايلينا Stamenova، إيفان Bochkov، جيم روبنسون، أدريان سانبورن، ايدو Machol، ارينا عمر، إيريك لاندر واريز ليبرمان ايدن. وهناك خريطة 3D من الجينوم البشري في كيلو قاعدة قرار يكشف مبادئ الكروماتين حلقات، خلية (2014).

* ساهمت بالتساوي

لاحظ أن البيانات المستخدمة لتوليد المشهد هي منطقة صغيرة للغاية من خريطة الجينوم على نطاق كامل. خريطة الاتصال الكاملة لجينوم البشري هي تريليون مرات أكبر من هذه الخريطة.

معرفة المزيد عن عملنا في www.aidenlab.org.

الموسيقى: صعود كتبها Stellardrone

هام: لعرض بشكل صحيح التطبيق، وسماعة رأس الواقع الافتراضي، مثل جوجل الكرتون، Durovis الغوص، أو سامسونج جير VR ينبغي أن تستخدم.